民進黨這次只拿下27席，黨主席陳總統在第一時間請辭以示負責。接下來總統大選的操盤由謝長廷全盤掌控，謝長廷將接下代理主席；他說如果大選失敗，他將退出政壇。 　　府院高層面色凝重，向支持民眾深深一鞠躬表達歉意；立委大敗衝擊，民進黨高層會議氣氛凝重。據了解，陳總統對於結果比預期還糟非常自責，一開始就堅持要請辭黨主席以示負責，行政院正副院長張俊雄、邱義仁也跟進，要辭去黨務和選務職位，謝長廷和葉菊蘭連忙慰留；謝長廷還提出請假或代理等方案，希望慰留陳總統，渡過黨的危機，打完總統大選。不過，心直口快的呂秀蓮看不下去，直言大家太假了，根本沒有好好檢討，並建議由總統參選人謝長廷主掌黨機器，讓未來黨務選務合一，拼大選才是事實，最後達成共識。